Error message

  • Deprecated function: Unparenthesized `a ? b : c ? d : e` is deprecated. Use either `(a ? b : c) ? d : e` or `a ? b : (c ? d : e)` in include_once() (line 1439 of /home/science2016/public_html/includes/bootstrap.inc).
  • Deprecated function: Array and string offset access syntax with curly braces is deprecated in include_once() (line 3557 of /home/science2016/public_html/includes/bootstrap.inc).

Обчислювальний молекулярний докінг, волтаметричні та спектроскопічні дослідження взаємодії ДНК з 9n-(ферроценілметил)аденіном

Elhafnaoui Lanez1, 2, Lazhar Bechki2, Touhami Lanez1
Affiliation: 
1 University of El Oued, VTRS Laboratory, B.P.789, 39000, El Oued, Algeria 2 University of Ouargla, Chemistry Department, PO Box 511, 30000, Ouargla, Algeria touhami-lanez@univ-eloued.dz
DOI: 
https://doi.org/10.23939/chcht13.01.011
AttachmentSize
PDF icon full_text.pdf813.04 KB
Abstract: 
З використанням методів циклічної вольтамперометрії та електронної спектроскопії за однакових умов проведені вимірювання вільної енергії 9N-(ферроценілметил)аденину (ФMA) з дволанцюговою ДНК. Отримані результати підтверджені обчислювальним молекулярним докінгом. Показано, що док-результати добре узгоджуються з експериментальними даними і що ліганд ФMA поміщений у невелику борозенку спіралі ДНК.
References: 

[1] Kealy T., Pauson P.: Nature, 1951, 168, 1039. https://doi.org/10.1038/1681039b0
[2] Miller S., Tebboth J., Tremaine J.: J. Chem. Soc., 1952, 632. https://doi.org/10.1039/JR9520000632
[3]Wilkinson G., Rosenblum M., Whiting M. et al.: J. Am. Chem. Soc., 1952, 74, 2125. https://doi.org/10.1021/ja01128a527
[4] Xian-Feng H., Ling-Zhu W., Long T. et al.: J. Organomet. Chem., 2014, 749, 157. https://doi.org/10.1016/j.jorganchem.2013.08.043
[5] Lal B., Badshah A., Altaf A. et al.: Dalton. Trans., 2012, 41, 14643. https://doi.org/ 10.1039/C2DT31570J
[6] Ornelas C.: New J. Chem., 2011, 35, 1973. https://doi.org/ 10.1039/C1NJ20172G
[7] Kondapi A., Satyanarayana N., Saikrishna A.: Arch. Biochem. Biophys., 2006, 450, 123. https://doi.org/ 10.1016/j.abb.2006.04.003
[8] Struga M., Kossakowski J., Kedzierska E. et al.: Chem. Pharm. Bull., 2007, 55, 796. https://doi.org/10.1248/cpb.55.796
[9] Biot B., Francois N., Maciejewski L. et al.: Bioorg. Med. Chem. Lett., 2000, 10, 839. https://doi.org/10.1016/S0960-894X(00)00120-7
[10] Itoh T., Shirakami S., Ishida N. et al.: Bioorg. Med. Chem. Lett., 2000, 10, 1657. https://doi.org/ 10.1016/S0960-894X(00)00313-9
[11] Swarts J., Vosloo T., Cronge S. et al.: Anticancer Res., 2008, 28, 2781.
[12] Acevedo-Morantes C., Meléndez E., Singh P. et al.: J. Cancer. Sci. Ther., 2012, 4, 271. https://doi.org/10.4172/1948-5956.1000154
[13] Morad M., Sarhan A.: Science, 2008, 50, 744. https://doi.org/10.1016/j.corsci.2007.09.002
[14] Gupta S., Mourya P., Singh M. et al.: J. Organomet. Chem., 2014, 767, 136. https://doi.org/10.1016/j.jorganchem.2014.05.038
[15] Van Staveren D., Metzler-Nolte N.: Chem. Rev., 2004, 104, 5931. https://doi.org/10.1021/cr0101510
[16] Fouda M., Abd-Elzaher M., Abdelsamaia R. et al.: Appl. Organomet. Chem., 2007, 21, 613. https://doi.org/10.1002/aoc.1202
[17] Lal B., Badshah A., Altaf A. et al.: Dalton. Trans., 2012, 41, 14643. https://doi.org/10.1039/C2DT31570J
[18] Scaria V., Furlani A., Longato B. et al.: Inorg. Chim. Acta, 1988, 153, 67. https://doi.org/10.1016/S0020-1693(00)83359-9
[19] Neuse E., Meirim M., Blom N.: Organometallics, 1988, 7, 2562. https://doi.org/10.1021/om00102a023
[20] Houlton A., Roberts R., Silver J.: J. Organomet. Chem., 1991, 418, 107. https://doi.org/10.1016/S1387-1609(00)00118-3
[21] Houlton A., Christian J., Ashleigh E. et al.: J. Chem. Soc., Dalton Trans., 1999, 3229. https://doi.org/10.1039/A905168F
[22] Price C., Aslanoglu M., Christian J. et al.: J. Chem. Soc., Dalton Trans., 1996, 4115. https://doi.org/10.1039/DT9960004115
[23] Ali S., Badshah A., Ataf A.: Med. Chem Res., 2013, 22, 3154. http://dx.doi.org/10.1007/s00044-012-0311-8
[24] Hussain R., Badshah A., Tahir M. et al.: Aust. J. Chem., 2013, 66, 626. https://doi.org/10.1071/CH12570
[25] Jalali F., Dorraji P.: J. Pharm. Biomed. Anal., 2012, 70, 598. https://doi.org/10.1016/j.jpba.2012.06.005
[26] Radi A., Eissa A., Nassef H.: J. Electroanal. Chem., 2014, 717, 24. https://doi.org/10.1016/j.jelechem.2014.01.007
[27] Osgerby J., Pauson P.: J. Chem. Soc., 1958, 642, 656. https://doi.org/10.1039/JR9580000656
[28] Snegur L., Yu S., Nekrasov N. et al.: Appl. Organomet. Chem., 2008, 22, 139. https://doi.org/10.1002/aoc.1362
[29] Sambrook J., Fritsch E., Maniatis T.: Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edn., Cold Spring Harbour Laboratory Press, New York 1989, 1626-1644.
[30] Glasel J.: Biotechniques, 1995, 8, 62.
[31] Vijayalakshmi R., Kanthimathi M., Subramanian V. et al.: Biochem. Biophys. Res. Commun., 2000, 271, 731. https://doi.org/10.1006/bbrc.2000.2707
[32] Lu X., Zhu K., Zhang M. et al.: J. Biochem. Biophys. Met., 2002, 52, 189.
[33] Aslanoglu M., Ayne G.: Anal. Bioanal. Chem., 2004, 380, 658. https://doi.org/10.1007/s00216-004-2797-5
[34] Zhao G., Zhu J., Zhang J. et al.: Anal. Chim. Acta., 1999, 394, 337. https://doi.org/10.1016/S0003-2670(99)00292-5
[35] Atkins P.: Physical Chemistry. Oxford University Press, Oxford 1986, 263-265.
[36] Xu Z., Bai G., Dong C.: Bioorg. Med. Chem., 2005, 13, 5694. https://doi.org/10.1016/j.bmc.2005.06.023
[37] Ye H., Cande C., Stephanou N.: Nat. Struct. Mol. Biol., 2002, 9, 680. https://doi.org/10.1038/nsb836
[38] Li D., Huang F., Chen G. et al.: J. Inorg. Biochem., 2010, 104, 431. https://doi.org/10.1016/j.jinorgbio.2009.12.008
[39] Brett C., Brett A.: Electrochemistry: Principles, Methods and Applications, Oxford Science University Publications, Oxford 1993, 256-276.
[40] Nie M., Wang Y., Li H.: Pol. J. Chem., 1997, 71, 816.
[41] Frisch M., Trucks G., Schlegel H. et al.: Gaussian 09. Gaussian Inc., Wallingford CT, 2009.
[42] Becke A.: J. Chem. Phys., 1993, 98, 5648. https://doi.org/10.1063/1.464913
[43] Miehlich B., Savin A., Stoll H. et al.: Chem. Phys. Lett., 1989, 157, 200. https://doi.org/10.1016/0009-2614(89)87234-3
[44] Morris G., Ruth H., Lindstrom W. et al.:J. Comput. Chem., 2009, 30, 2785. https://doi.org/10.1002/jcc.21256
[45] Berman H., Westbrook J., Feng Z. et al.: Nucl. Acids Res., 2000, 28, 235.
[46] Lanez T., Benaicha H., Lanez E. et al.: J. Sulfur Chem., 2018, 39, 76. https://doi.org/10.1080/17415993.2017.1391811